「湘南発見ゾーン」と「湘南体験ゾーン」の２つのゾーンで構成し、前者は情報センターやフィールド学習を行いながら実験学習を行い、後者は、「なぎさを歩く」、「なぎさを守る」、「なぎさを探る」をテーマとした展示体験学習の構成とする。
・ 「湘南発見ゾーン」
湘南海岸の自然を軸としフィールドと施設を行き来しながら学習プログラム、ワークショップ型の体験学習（創作活動、実験、観察）を行う。県民、市民に向け、研究会を開催し、自然や文化を親しむプログラムを年間を通して開催する機能を持つ。資料室としての機能や、調査研究を公開する機能も有する。
・ 「湘南体験ゾーン」
湘南海岸の自然、文化、環境問題にも触れることができ、楽しみながら理解できる体験学習を主体におく。